2026년 4월 1일 시행

희귀난치성질환 의약품
관세·부가세 전면 면제!

한국희귀·필수의약품센터 경유 시
관세 8% + 부가세 10% → 0원

2026년 4월 1일부터 한국희귀·필수의약품센터를 통해 들여오는 희귀난치성질환 자가치료용 의약품의 관세(8%)와 부가세(10%)가 전면 면제됩니다. 엄청난 약값 부담을 조금이나마 덜 수 있는 이번 제도의 면제 대상과 신청 방법을 확실하게 정리해 드릴게요.

혹시 본인이나 가족 중에 희귀질환으로 약을 구하고 계신 분이 있다면 오늘 글을 꼭 끝까지 읽어주세요!

섬네일


2026년 4월부터 달라진 의약품 관세·부가세 면제란 뭘까요?

희귀질환을 앓고 계신 분들이나 보호자분들이라면, 국내에 없는 약을 해외에서 구하는 과정이 얼마나 힘들고 비싼지 다들 공감하실 거예요. 저도 예전에 아는 분이 해외에서 희귀질환 약을 수입할 때 약값 자체도 비싸지만, 거기에 붙는 세금 때문에 허리가 휜다는 이야기를 듣고 참 마음이 아팠던 적이 있거든요.

이번 희귀난치성질환 의약품 관·부가세 면제 제도는 해외에서 들여오는 자가치료 목적의 약품에 부과되던 세금(관세 8%, 부가세 10%)을 0원으로 깎아주는 제도를 의미해요. (2026년 4월 1일 시행)

💡 약값 1,000만 원 기준 세금 비교

❌ 기존 (면제 전)
✅ 현재 (면제 후)
~200만 원 관세 80만 원
+ 부가세 약 108만 원
0원 관세 0원
+ 부가세 0원

이게 왜 중요하냐면요, 약값이 천만 원이라고 가정했을 때 기존에는 관세 80만 원에 부가세까지 더해져 세금만 거의 200만 원 가까이 낼 수도 있었기 때문이에요.

8% 관세 면제
10% 부가가치세 면제
0원 면제 후 세금 부담
"4월 1일부터 희귀난치성질환 치료용 의약품에 대한 관세와 부가가치세가 면제되어 환자의 치료 접근성이 크게 확대된다" — 2026년 4월 2일, 대한민국 정책브리핑 및 식품의약품안전처 공식 발표

이제는 그 막막했던 세금 부담을 확실히 덜 수 있게 된 거죠.

어떤 약들이 세금 면제 혜택을 받을 수 있을까요?

그렇다면 "내가 직구로 사는 약도 다 면제되는 건가?" 하고 궁금하실 텐데요. 그건 아니에요. 정확한 기준이 정해져 있답니다.

관세 면제 대상 의약품의 가장 큰 기준은 반드시 '한국희귀·필수의약품센터'를 통해 구매를 신청한 자가치료용 의약품이거나, 식약처장이 긴급 도입을 인정한 약이어야 한다는 점이에요.

이 부분은 법으로도 명확하게 박혀 있어요.

"한국희귀·필수의약품센터가 수입하는 희귀난치성 질환 치료용 의약품 중 환자가 구매를 신청한 의약품 및 식품의약품안전처장이 도입 필요성을 인정한 의약품의 관세를 감면한다" — 관세법 시행규칙 제39조 5항 (2026년 3월 개정, 4월 1일 시행)

정리하자면, 세금 면제를 받을 수 있는 약의 종류는 크게 두 가지예요.

1 환자 본인의 치료를 위해 센터에 수입을 신청한 자가치료용 의약품
2 한국희귀·필수의약품센터가 직접 공급하는 긴급도입 의약품

💊 질환별 세금 면제 대상 주요 치료약 품목

🧬
고셔병 (Gaucher)
치료약 이미글루세라제 (세레자임)
면제 기존 면제 유지
🩸
혈우병 (Hemophilia)
치료약 혈액응고인자 제제
면제 기존 면제 유지
🧠
부신백질이영양증 (ALD)
치료약 로렌조 오일 계열
면제 기존 면제 유지
💉
파브리병 (Fabry)
치료약 아갈시다제 (파브라자임)
면제 신규 확대 적용
💪
폼페병 (Pompe)
치료약 알글루코시다제 (마이오자임)
면제 신규 확대 적용
🫀
급성 간성 포르피린증 (AHP)
치료약 기브라리 (2026.2 허가)
면제 신규 확대 대상
🔬
알파-만노사이드축적증
치료약 람제데주 (2026.1 허가)
면제 신규 확대 대상
🧒
소아 난치성 뇌전증
치료약 에피디올렉스 (대마 성분 의약품)
면제 센터 긴급도입 품목
📋
기타 희귀난치성질환 전체
대상 보건복지부장관이 고시한 희귀질환 및 중증난치질환 산정특례 대상 질환 치료를 위해 센터를 통해 수입하는 모든 의약품
면제 신규 전면 확대
기존 면제 유지 신규 확대 적용 센터 긴급도입

💰 연간 약값별 세금 절감 시뮬레이션

약값
1,000만 원
기존 세금 약 188만 원
→ 약 188만 원 절감!
약값
3,000만 원
기존 세금 약 564만 원
→ 약 564만 원 절감!
약값
1억 원
기존 세금 약 1,880만 원
→ 약 1,880만 원 절감!
약값
3억 원
기존 세금 약 5,640만 원
→ 약 5,640만 원 절감!

📌 위 표는 대표적인 질환과 치료약 예시이며, 면제 대상은 특정 약 품목명이 아니라 '센터를 통해 수입하는 희귀난치성질환 치료용 의약품 전체'에요. 전체 대상 품목과 최신 긴급도입 목록은 한국희귀·필수의약품센터 홈페이지(kodc.or.kr)에서 확인하시거나, 건강팔팔 핫라인 02-508-7318로 문의해 주세요.

개인적으로 알음알음 해외 직구 사이트에서 사는 약은 해당되지 않으니, 꼭 공식 기관인 센터를 거치셔야 한다는 점 잊지 마세요!

면제 신청 방법과 꼭 챙겨야 할 필수 서류

직접 행정 처리를 해본 결과, 이런 절차는 처음엔 서류 이름만 들어도 머리가 아프기 마련이죠. 하지만 막상 챙겨보면 그렇게 복잡하지 않아요.

한국희귀·필수의약품센터를 통해 관·부가세 면제를 신청하기 위한 주요 필수 서류의 핵심은 '이 약이 희귀난치성질환 치료 목적에 꼭 필요하다는 걸 증명하는 것'이에요.

📋 필수 서류 & 절차

서류1
치료 목적 소견이 담긴 진단서 — 의사 선생님께 진료를 보실 때, 해당 해외 의약품이 환자의 치료를 위해 꼭 필요하다는 소견을 진단서에 명확히 적어달라고 요청하셔야 해요.
서류2
자가치료용 의약품 수입 신청 서류 — 센터 홈페이지에서 안내하는 기본 양식을 작성하시면 됩니다.
제출
서류를 구비해서 한국희귀·필수의약품센터에 제출하면서 면제를 함께 신청하는 구조예요.

"나는 처음이라 도대체 무슨 말인지 하나도 모르겠다!" 하시는 분들도 너무 걱정하지 마세요. 센터에서 이번 제도 시행 초기라 환자분들이 헷갈리지 않도록 전담 상담 번호를 열어두었거든요.

"한국희귀·필수의약품센터는 '건강팔팔 핫라인(02-508-7318)' 운영을 통해 자가치료의약품을 처음 신청하는 환자가 어려움을 겪지 않도록 면세적용 요건 서류 안내 및 맞춤형 상담 서비스를 제공한다" — 2026년 4월, 의학신문 보도
💡

서류 준비하시기 전에 저 핫라인(02-508-7318)으로 먼저 전화를 걸어서 내 상황에 맞는 서류를 다시 한번 확인해 보시는 걸 강력히 추천해 드려요.

자주 묻는 질문 (FAQ)

Q. 개인이 해외 약국 사이트에서 직접 구매(직구)해도 세금이 면제되나요?

아니요, 면제되지 않아요. 이 제도는 반드시 국가 공공기관인 '한국희귀·필수의약품센터'를 통해서 수입을 진행한 의약품에만 적용된답니다. 일반적인 해외 직구에는 기존과 동일한 세금이 부과돼요.

Q. 부가세 10%만 면제되는 건가요?

아닙니다! 의약품을 수입할 때 붙는 관세(일반적으로 8%)와 부가가치세(10%)가 '모두' 면제되는 거예요. 약가가 비쌀수록 체감되는 할인 폭이 엄청나게 크겠죠?

Q. 저는 희귀난치성질환 산정특례 환자가 아닌데, 센터에서 약을 사면 면제되나요?

이 혜택은 '희귀난치성질환' 치료를 목적으로 하는 환자분들을 위한 제도예요. 따라서 의료진의 진단서 등을 통해 해당 질환의 치료 목적임이 서류상으로 증명되어야만 면제 혜택을 받을 수 있어요.

Q. 신청 절차가 막막한데 어디서 도움을 받을 수 있나요?

한국희귀·필수의약품센터에서 운영하는 '건강팔팔 핫라인(02-508-7318)'으로 전화하시면 나에게 맞는 구비 서류와 절차를 친절하게 안내받으실 수 있어요.

정리하면요

2026년 4월 1일부터 새롭게 시작된 희귀난치성질환 자가치료용 의약품의 관·부가세 면제! 솔직하게 말씀드리면, 그동안 고가의 약값 때문에 눈물 삼키셨던 수많은 환우와 가족분들에게 가뭄에 단비 같은, 정말 실질적이고 고마운 제도가 아닐 수 없어요.

📌 한눈에 보는 핵심 정리

혜택 관세(8%) + 부가세(10%) 전액 면제
조건 한국희귀·필수의약품센터를 통한 수입 및 긴급도입 의약품
서류 치료 목적 소견이 포함된 진단서 등
문의 건강팔팔 핫라인 (02-508-7318)

혹시 이 글을 읽으시는 분들 중에서 직접 약을 들여와 보셨거나, 행정 절차를 밟아보신 분이 계시다면 댓글로 여러분의 경험을 꼭 공유해 주세요. 처음이라 막막한 다른 환우 가족분들에게 그 짧은 팁 하나가 정말 큰 위로와 힘이 되거든요!

다음 포스팅에서는 새롭게 업데이트된 희귀질환 산정특례 등록 방법에 대해서도 자세히 다뤄보겠습니다.

⚠ 안내
이 글은 정보 제공을 목적으로 작성되었으며 의학적 진단이나 조언을 대신할 수 없어요. 환자의 정확한 질병 상태에 따른 의약품 투여 여부는 반드시 전문 의료인과 상의하시고, 세금 면제를 위한 구체적인 행정 요건은 공식 기관(한국희귀·필수의약품센터)에 꼭 최종 확인하시기 바랍니다.
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Author Bio

건강 정보를 꾸준히 정리하고 공유하는 블로거예요. 의료 전문가는 아니지만, 정부 기관과 신뢰할 수 있는 자료를 바탕으로 복잡한 제도를 쉽고 정확하게 전달하려고 노력하고 있어요. 건강 관련 구체적인 진단과 처방은 반드시 여러분의 주치의 선생님과 상의해 주세요!